《通知》指出，加快提升农业科技创新体系整体效能，必须坚持进一步全面深化改革，切实解决好各自为战、低水平重复、转化率不高等突出问题，激发创新活力。坚持农业科技公共性基础性社会性定位，推动有为政府和有效市场更好结合。坚持产业需求导向，推动农业科技创新和产业创新融合发展。坚持守正创新，尊重农业科技创新特点和规律创造性统筹谋划推进。坚持人才引领发展，充分发挥农业科技人员积极性。
《通知》指出，到2035年，我国将建成运转高效的农业科技创新体系，农业科技创新和产业创新深度融合，涌现一批创新能力和综合实力全球领先的农业科技领军企业，形成一批有国际影响力的国家农业战略科技力量和战略人才力量，农业基础研究和原始创新能力显著增强，重点领域关键核心技术自主可控，农业科技创新整体水平居于世界前列，实现高水平农业科技自立自强，为农业强国建设提供强有力的支撑。
《通知》还从强化相关科研院所、高校科技创新核心使命、加快培育壮大农业科技领军企业、优化农业科技创新组织机制、建强农业科技人才队伍、提升农业科技条件支撑能力、加快农业科技成果转化、推动农业科技高水平开放合作、改善农业科技创新生态、加强组织保障九个方面提出具体要求。
